一、工程索赔时效的功能
1、促使权利人行使权利。“法律不保护躺在权利上睡觉的人”，索赔时效是由其本质决定的，索赔时效是时效制度中的一种。其功能类似于民法中的诉讼的时效。也就是说，超过法定期间，权利人不主张自己的权利，则诉讼权消灭，人民法院不再强制对该实体权利进行保护。通过此种方法来督促权利人积极行使自己的权利，这也是索赔时效的功能。
2、索赔时效具有平衡业主和建筑承包商利益的功能。在施工合同索赔中，业主通常是作为被索赔方，其与建筑承包商比较而言，对施工过程的参与程度和熟悉程度相对较为肤浅，施工记录也相对较为简单。由于索赔事件（如由于发包人错误指令造成连续浇注的混凝土施工异常中断，额外增加施工缝费用；有经验的承包商也不能预见到的不利的自然条件如异常的地下水位）往往持续时间短暂，事后难以复原，业主难以在时过境迁后查找到有力证据来确认责任归属，或准确评估所发生的费用数额。因此，如果允许承包商隐瞒索赔意图，对其索赔权不加时间限制，无疑将置业主于不利状态。索赔时效平衡了业主和承包商的利益。一方面，在索赔时效制度下，凡索赔时效期间届满，即视为不行使索赔权的承包商放弃索赔权利，业主可以以此作为证据的代用，避免举证的困难；另一方面，只有促使承包商及时地提出索赔要求，才能警示业主充分履行合同义务，避免相类似索赔事件的再次发生。
3、索赔时效有利于索赔的客观、公正、经济的解决。索赔肯定会有分歧，尤其是引起索赔的事件已经完成很长时间后才提起索赔，分歧会更加严重。如果没有索赔时效的限制，索赔权利人甚至可能会在工程完工才提出一揽子索赔。时过境迁、人员变动，使得索赔事件的真实状况很难复原，因而导致业主和承包商均依据各自的记录阐述各自理由，而双方必然都认为自己才真实地记录了索赔事件，使得索赔很难通过协商解决，由此引发的合同争端只能通过调解、仲裁或诉讼等方式解决，增加了双方的费用和成本。且由于双方各自的记录往往差异较大，因而对调解人、仲裁人或法官而言，客观、准确地认识事件真相，公平合理地处理争端，将是一项棘手的工作。确定较短的索赔期间，有利于证据保存，使索赔事件的真相较容易查明，有利于索赔的快速解决，避免元谓的旷日持久的争端。因此，索赔时效对业主和承包商而言，都是经济的。对社会而言，可避免社会资源的浪费，更好地发挥财产的效用，因而对促进社会经济发展大有裨益。
二、工程索赔时效的法律基础
虽然索赔时效已通行于建筑业，几成行业惯例，但在法律未将之纳入明文规定之前（如像保险法第26条对保险索赔时效的明确规定），仍不属于法定制度，仅属当事人的合同约定。然而，基于意思自治、合同自由的合同法原则，施工合同当事人在不违反法律、法规禁止性规定的前提下，其协商一致的索赔时效合同条款，应属合法有效。
根据合同法第八条“依法成立的合同，对当事人具有法律约束力”的规定，施工合同索赔时效的约定，据此具有了法律约束力。因此，对于那些超过索赔期限的索赔要求，根据索赔时效的特性和合同的性质，不再具有法律约束力，自然难以诉请法院获得法律支持。
