在劳动合同履行过程中，如果劳动者没有按照岗位职责履行自己的义务，有未尽职责的严重过失行为或者利用职务之便谋取私利的故意行为，使用人单位有形财产、无形财产遭受重大损害，就应当赔偿单位的损失。
一、违反保密协议如何赔偿
对劳动者违反保密约定或竞业限制约定侵犯用人单位商业秘密导致损失的情形，根据相关规定，可以按《反不正当竞争法》第二十条的规定进行赔偿（《反不正当竞争法》规定，经营者违反本法规定，给被侵害的经营者造成损害的，应当承担损害赔偿责任，被侵害的经营者的损失难以计算的，赔偿额为侵权人在侵权期间因侵权所获得的利润；并应当承担被侵害的经营者因调查该经营者侵害其合法权益的不正当竞争行为所支付的合理费用）。
二、员工如何赔偿给单位造成的损失
员工在职期间因职务行为导致企业损失的情形，根据相关规定，只能要求劳动者进行限额赔偿，如劳动部印发的《工资支付暂行规定》第16条规定：因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。
经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
《上海市企业工资支付办法》亦规定，劳动者因本人原因给单位造成经济损失，用人单位依法要其赔偿，并需从工资中扣除赔偿费的，扣除的部分不得超过劳动者当月工资收入的20%，且扣除后的剩余工资不得低于本市规定的最低工资标准。
用人单位支付给劳动者的对价即劳动报酬与劳动者创造的劳动成果具有不对等性，企业作为劳动成果的享有者，更应承担经营风险。用人单位追究劳动者的赔偿责任主要以民法通则等作为法律依据，以实际损失为主要参照标准。发生这种纠纷后，建议员工请律师协助解决，赔偿纠纷无小事。
