一、组织、领导、参加恐怖组织罪的构成
组织、领导、参加恐怖组织罪是指以进行恐怖活动为目的，组织、领导、积极参加或者其他参加恐怖组织，危害公共安全的行为。重要的是把握恐怖组织的含义。国际上曾将恐怖组织定义为：直接反对一个国家，而其目的和性质是在个别人士、个人团体或公众中制造恐怖的犯罪行为。恐怖组织实施的恐怖活动是指为了达到一定目的特别是政治目的，而对他人的生命、身体、健康、自由、财产等使用暴力、胁迫等手段以造成社会恐惧的犯罪行为的总称。其特征是①主体必须是3人以上；②以实施恐怖活动为目的；③具有严密的组织性；④具有一定的稳定性；⑤具有极大的社会危害性和危险性。
本罪不是直接针对制造恐怖气氛的恐怖行为，而是组织、领导、参加恐怖组织的行为。修正案将其作了区分：组织、领导者，积极参加者以及其他参加者三种情形，并提高了法定刑。97刑法规定的法定最高刑为10年有期徒刑，被提高到无期徒刑。其立法理由在于：因为只要参加即构成犯罪，如果恐怖组织实施了危害社会的行为构成犯罪的，实行数罪并罚。应当说这样的法定刑已经很高了。但由于一旦恐怖组织成立后，就对社会构成潜在的巨大威胁，再来打击可能显得有点为时已晚，已经9.11事件发生后，使立法者感到有必要加大对恐怖组织本身的打击力度，将其消灭在萌芽状态中，故作了上述修改，并且规定了资助恐怖活动罪。因为刑法的专门规定，所以组织、领导、参加恐怖活动组织的行为，是实行行为。同理，组织、领导、参加黑社会性质组织的行为，也是实行行为。此外的组织犯罪集团的行为，一般是预备行为而不属于实行行为。如为了盗窃而组织盗窃集团，为了抢劫而组织抢劫集团。这个组织行为本身是预备行为，只要行为人没有开始窃取、暴力抢劫行为，还是预备行为。其实行行为标准是看行为人实施的是不是分则条文规定的某一犯罪行为。因为组织、领导、参加恐怖组织在分则条文中被单独规定为一种犯罪行为，所以有此行为，就是有实行行为。在理论上有学者将其称为举动犯。这一点与组织、参加、领导黑社会性质组织罪相同。
二、组织、领导、参加恐怖组织罪的罪数形态
组织、领导、参加了这个集团，又进行恐怖活动构成其他犯罪的，比如说，谋杀、绑架、放火、爆炸的，一定要数罪并罚。但是，如果组织、领导、参加毒品犯罪集团，又进行毒品犯罪活动的，不存在对组织等行为与毒品犯罪行为数罪并罚的问题。不过，如果集团实施了毒品以外的犯罪的，如暗杀、绑架，则应当与毒品犯罪行为数罪并罚。
三、组织、领导、参加恐怖组织罪如何判刑罚
经2001年《刑法修正案》（三）修订，提高了本罪的法定刑："组织．领导恐怖活动组织的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑；积极参加的，处三年以上十年以下有期徒刑；其他参加的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利。"
