单位共同犯罪的刑事责任问题涉及单位共同犯罪的主、从犯的区分问题，涉及单位共同犯罪的刑事责任在作为共犯的单位与单位之间或单位与自然人之间的分配，涉及单位共同犯罪的刑事责任在共犯单位的直接责任人员之间的再分配。
一、单位共同犯罪的主、从犯如何区分
既然都是共同犯罪，则单位共同犯罪的主、从犯的区分的原理应同于自然人共同犯罪，即按照共犯在共同犯罪中地位主次和作用大小去加以确定。但单位共同犯罪毕竟是单位共同犯罪，其主、从犯的区分自有其特殊性。在司法实践中，我们应注意：第一，无论是在纯粹的单位共同犯罪中，还是在非纯粹的单位共同犯罪中，犯罪单位是主犯还是从犯，不仅要考察犯罪单位的直接责任人员在单位共同犯罪中的地位和活动本身，更要考察犯罪单位在单位共同犯罪中所提供的有形的或无形的犯罪条件，因为犯罪单位既是一个人为系统，又是一个物质系统，犯罪单位所提供的物质条件往往是单位共同犯罪得以进行和完成的先决性的或根本性的条件。
因此，我们在区分单位共同犯罪特别是非纯粹的单位共同犯罪的主、从犯时，不能把目光仅停留于涉案人员言谈举止本身，更不要为其所迷。故而，在非纯粹的单位共同犯罪中，犯罪单位通常为主犯，但不排除在少数情况下，自然人共犯同为主犯或自然人共犯为主犯而犯罪单位为从犯;第二，单位共同犯罪中也会有胁从犯的存在。尽管在单位共同犯罪中存在着为了单位的利益这一说法，但也不排除犯罪单位的有关涉案人员明知参与行为为违法犯罪而本不情愿参与，但在利害因素的强压之下而勉强参与。并且，该利害因素往往来自于犯罪单位的有关直接负责的责任人员，如以解除劳动关系相威胁。
二、单位共同犯罪的刑事责任
纯粹单位共同犯罪的刑事责任包括犯罪单位的刑事责任和犯罪单位的直接责任人员的刑事责任两个方面。
1.犯罪单位的刑事责任。对于纯粹的单位共同犯罪，应先根据对整个共同犯罪事实的分析，按照在整个共同犯罪中的地位主次和作用大小来确定单位主犯和单位从犯，然后量定单位主犯的刑罚，最后再按照“对于从犯，应当从轻、减轻或者免除处罚”的规定量定单位从犯的刑罚。在新刑法规定的双罚制下，由于对犯罪单位只能适用罚金，故对单位从犯的从轻、减轻或免除处罚也只是意味着单位从犯的处罚是相对于单位主犯在罚金数额上的减少或免除。
相对来说，纯粹的单位共同犯罪的单位主、从犯的刑事责任的分配是较为容易的。
2.直接责任人员的刑事责任。相对于单位主、从犯的刑事责任，这是一个稍加复杂的问题，因为每个单位共犯的直接责任人员都可能有主、从犯之分，而所有单位共犯的直接责任人员的主、从犯放在一起又会有主从比较。对此，有论者说：“也不排除这样一种可能性，就是法人从犯中犯罪人员在法人犯罪中发挥了比某些法人主犯中的犯罪人员更重要的作用，并因此承担较重的刑事责任。”
我们认为，论者道出了纯粹单位共同犯罪中直接责任人员的主、从犯的区分问题，但论者的说法不够准确，因为论者所言可能包含这样一层意思：法人从犯中直接责任人员的从犯比法人主犯中直接责任的主犯起更重要的作用，并因此承担较重的刑事责任。因此，论者所言应纠正为：不能排除这样一种可能性，就是法人从犯中的某个或某些直接责任人员在法人共同犯罪中比法人主犯中的某个或某些直接责任人员(不包括作为主犯的直接责任人员)发挥了更重要的作用，并因此承担较重的刑事责任。
在上文分析的基础上，笔者提出纯粹的单位共同犯罪各方直接责任人员的处罚方法：先分析单位共犯各方的直接责任人员在单位共同犯罪中的地位主次和作用大小，后确定整个单位共同犯罪的主、从犯及胁从犯，再按共犯处罚的有关规定去处罚。
