一、强奸罪与侮辱尸体罪的区别
强奸罪与侮辱尸体罪明显不同，一般不会发生混淆。但有时候，如行为人出于抢劫、故意杀人等目的杀害妇女后，又对之尸体进行奸淫的，奸淫尸体行为如果构成犯罪，就应以抢劫罪、故意杀人罪与侮辱尸体罪实行并罚。行为人采取暴力手段强奸妇女致其死亡，或者遭遇反抗将其杀害后又奸尸的，奸尸这一侮辱行为应为强奸行为所吸收，不再成立独立之罪。行为人以为妇女已经死亡，而对之进行奸淫，不想妇女处于假死状态，这时，应以侮辱尸体罪依法追究行为人的刑事责任，而不构成强奸罪。但在妇女醒后仍然强行对之奸淫，或见之并未死亡，仍乘其昏迷等对之进行奸淫的，则应以强奸罪依法定罪科刑。
二、强奸罪与奸淫幼女罪的区别
（一）侵害的客体不同。强奸罪侵害的客体，是妇女性的不可侵犯的权利，而奸淫幼女罪侵害的客体、则是幼女的身心健康。因为幼女正在发育成长时期，对社会生活中的许多事物缺乏辨别能力，既不知道性交行为的性质和可能产生的结果，也不可能真正表达自己的意志，容易上当受骗，幼女被奸后，往往会摧残幼女的身心健康。这两个罪不仅侵害的客体不同、而且侵犯的对象也不同。强奸罪侵犯的对象是14同岁以上少女或者成年妇女，奸淫幼女罪侵害的对象，只能是不满14同岁的幼女。
（二）客观方面不问，强奸罪，行为人使用暴力、胁迫或者从他手段，致使妇女不敢抗拒、不能抗拒、无法抗拒和不知抗拒，违背妇女意志，强行与之性交的行为。而奸淫幼女罪，则不论行为人采用什么手段，也不问幼女是否同意，只要与不满14周岁的幼女发生性交的行为，就构成奸淫幼女罪。
（三）主观故意的内容不同，强奸罪，行为人必须具有奸淫的目的，而且只有具有奸淫的目的，才能构成强奸罪，否则，就不构成此罪。而奸淫幼女罪、行为人不仅具有奸淫幼女的故意和奸淫的目的，而且行为人必须明知对方是不满14周岁的幼女，才能构成奸淫幼女罪。如果行为人确实无法从幼女的外表判断其叼可能尚不满14周岁，也不具备了解该幼女实际年龄的条件，也就不能定为奸淫幼女罪。按照《最高人民法院、最高人民检察院关于执行〈中华人民共和国刑法〉确定罪名的补充规定》（最高人民法院审判委员会第1193次会议、最高人民检察院第九届检察委员会第100次会议通过，自2002年3月26日起施行），奸淫幼女已一并纳入强奸罪，“奸淫幼女罪”罪名已经取消。
