一、输血医疗纠纷中被告主体的确定
输血医疗纠纷中，实施输血的医疗机构应承担直接责任是没有异议的，但医疗机构以外的其他民事主体也应承担相应的民事责任。
（1）提供血液的血站或血液非法采集人的民事责任。当医疗机构非法采集血液，成为非法采集人时，医疗机构应成为完全民事责任的承担者。
如果医疗机构使用的血液来源于非法采集人，而医疗机构在使用时也未进行严格的检验，此时医疗机构与非法采集人均有过错，均可成为医疗纠纷的被告。如果原告只以医疗机构为被告，医疗机构在赔偿后有权向非法采集人追偿。
如果血液来源于血站，因医疗机构的输血行为没有过错，此时原告应以血站作为被告，以血站在采集血液和检验过程中是否存在过错确定其应否承担民事责任。
如果血站提供的血液经过了严格的检验，但检验项目中未包括对原告致病病毒的检验，而也无强制性规定此项检验是必须的，此时医疗机构、血站与患者之间均无过错，应按民法通则第一百三十二条规定由三方分担责任。
如果原告只起诉医疗机构而拒绝起诉血站的，法院可判决医疗机构在一定范围内承担民事责任，血站所应承担的民事责任不应由医疗机构先行承担，而由原告另行起诉血站。
（2）血液提供人的民事责任。血液提供者是血液传播病症的源头。从维护健康有序的社会秩序来说，阻断血液提供者向非法采集人非法卖血的行为，也极有必要。
可以让非法卖血者承担一定的民事责任，即赋予受害者诉权，使其索赔权不仅可以指向医疗机构、血液采集者，也可以向卖血人索赔，但只能限于非法卖血者。对于向血站无偿献血的人，因其本人不负有检验血液的义务，即使其血液存在致病病毒，受害人也无权要求献血者赔偿经济损失。
二、输血医疗纠纷的诉讼时效
输血医疗纠纷案件作为人身损害赔偿案件的种类之一，其诉讼时效应适用民法通则第一百三十六条的规定，即身体受到伤害要求赔偿的诉讼时效期间为一年。
但在输血医疗纠纷中，由于错综复杂的病发现象和当事人主张权利的实际能力所受的影响，当事人往往在许多年后才提起诉讼。
如某人因输血感染艾滋病，数年后才得知患病，但并未提起诉讼。家属在其死亡后才向法院提起民事诉讼。如果从原告确认感染艾滋病时计算诉讼时效，则患者家属已丧失了胜诉权；如果从患者死亡之日起计算诉讼时效，则其家属尚有权获得民事赔偿。
从充分保护受害人权益的角度出发，对原告的诉讼时效期间标准不宜掌握过死。因为原告虽知患病，但其可能无法得知致病原因和侵权人是谁，这可能妨碍其正常行使诉讼权利，而且患者患病时，侵权人损害的是其健康权，患者死亡后，侵害的是其生命权，二种权利并不完全一致。
故患者家属在其死亡后才提出赔偿请求，应从生命权被侵害之日起计算诉讼时效期间。
