在软件盗版犯罪案件中，软件公司内部人员盗用软件源代码和程序，大肆制作盗版软件并销售牟利的情况时有发生。而针对这种侵犯计算机软件著作权犯罪行为的举证和调查将面临不同程度的难度。通常我们可以按照如下思路来进行调查侵权证据：
某些软件公司自我保护意识薄弱，在招聘人员时没有严格把关，只注重业务能力而忽视了对员工品质方面的要求，公司、企业内部又疏于管理，没有制定、完善相关的规章制度，尤其是对一些生产技术、科学领域内的智力创作成果，没有采取相关的保密制度和防范措施，致使犯罪嫌疑人有空可钻。
犯罪嫌疑人看中某种软件销路好，出于不劳而获的卑劣心态，利用工作便利，自己或唆使其他同事非法拷贝公司正版的系统软件，包括系统源代码和全部程序文件。比较谨慎的犯罪嫌疑人会想方设法对被盗系统进行表面上的修改，或将系统内的少数界面加以修饰或变脸，或将部分按扭位置稍作改动，但盗版系统一般除了一些文件、字节的长度和生成的时间与正版系统有所不同外，其源程序、数据库、运行过程等实质性内容则完全相同。
犯罪嫌疑人有时另行成立新的公司，有时出于掩人耳目或便于销售的目的，甚至还可能以原软件公司的子公司名义销售盗版软件。在这种案件中，调查人员应根据被害公司提供的情况展开调查，仔细排查公司内部人员和与其具有业务联系的人员，确定犯罪嫌疑人，并迅速派侦查员到与犯罪嫌疑人有业务往来的各个单位走访确定，经过内查外调，使案情明朗化。
同时，针对一些软件盗版犯罪行为无法直接和当事人联系上，通常采用在市场上看中某种产品，直接拿去反向或相关的方案公司进行破解，然后大肆进行销售侵权，这又需要另外一种调查思路，正确有利的固定住侵权销售行为，以侵权销售行为为基础点扩充其他证据材料，积极采取相关的处罚措施；
总之，在知识产权刑事犯罪案件中，软件盗版犯罪行为或侵犯计算机软件著作权犯罪行为都是一种较为难以取证的案件，而实务中要想解决，就需要拥有清晰思路的专业律师和较好的关系资源，在证据调查方面进行较好的融合，以达到相关部门的要求而启动官方的侵权打击行为；
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