关于发明专利申请实质审查的程序以及在应当注意的问题，下面做详细介绍：
发明专利申请自申请日起三年内，国务院专利行政部门可以根据申请人随时提出的请求，对其申请进行实质审查;申请人无正当理由逾期不请求实质审查的，该申请即被视为撤回。国务院专利行政部门认为必要的时候，可以自行对发明专利申请进行实质审查。
（一）、依照本条的规定，我国专利法对发明专利申请的实质审查，采取由申请人在法定期间内提出审查请求的方式予以启动，专利行政部门一般不主动对专利申请进行实质审查;专利申请人以外的其他人也无权要求对他人的专利申请进行实质审查。专利申请人提出进行实质审查请求的期间，为自提出专利申请之日起三年以内，在此期间，申请人可以随时向专利行政部门请求进行实质审查，如果自申请日起满三年，申请人未提出进行实质审查的请求，该申请即被视为自动撤回。
法律的这一规定，一是对专利申请人有利。进行实质审查，申请人是要交纳审查费的。如果申请人在提出申请后，认为其发明还不成熟，或者认为其发明已丧失新颖性，或者认为其发明缺乏经济价值时，可以不再请求实质性审查，也不用再缴纳实质审查的费用。二是可以大大减轻专利行政部门的审查工作负担。对发明专利申请进行实质审查相当复杂，如果专利行政部门对每一件发明专利申请都要主动进行实质审查，必然造成专利审查工作量过大，不利于提高审查工作效率。
（二）、如果国务院专利行政部门认为必要，也可主动对一项发明专利申请进行实质审查。如认为某项申请专利的发明对国家利益、社会利益有重大影响时，不必经专利申请人提出请求，国务院专利行政部门即可自行对发明专利申请进行实质审查。
