办理租赁合同登记对于当事人来说相当重要，因为租赁行为虽然是一种平等主体之间的民事行为，政府行政管理不宜过多干涉。但其行为客体———房屋却是一种特殊商品，与国土资源、人口、居住以及社会治安、环境保护密切相关，从而提出了对出租的房屋进行合法性审查的必要。“买卖不破租赁”虽然作为一项立法原则为各国立法所确立，但如何让新的买受人预先知道房屋存在租赁的事实，以减少风险并增加公平交易的机会，也是立法所应当考虑的。正是基于维护社会公平和市场交易秩序的理由，产生了对房屋租赁行为进行登记之需求———只有经过登记的房屋租赁行为，才受法律的保护，才能对抗第三人，否则，就不受法律保护，也不能对抗第三人。
房屋租赁关系会产生一些权利，改变优先承租权和优先购买权，经过登记的合同证据效力大于未登记的；由于合同登记管理机关审查房产证明和双方身份证，很大程度上保护承租人的权利，如有的设置了抵押权则起到提醒承租人的作用，可更好地保护承租人的利益。
曾有这样一个案例：
罗湖某大厦业主与承租人签订一份商铺租赁合同，约定了很高的租金，不是在主合同上约定，而是在附合同上约定，主合同和附合同都办理了合同登记。之后，承租人住进去了就不付租金，并将附合同抽掉其中的几页，但看起来还是相对完整的，认为租金约定不明。
发生纠纷后，最后以在管理部门登记的合同为准来付租金，这是因为，当事人进行房屋租赁合同登记时，登记管理机关会有留底合同，这样可以很好地保护双方当事人的合法权益。 办理合同登记，依法纳入管理后会享受很多后续的好处，未办登记是违法行为，办了登记发生纠纷后可由房屋租赁管理部门协调处理，起到很好的效果，且不办理登记还可能承担法律后果，不仅是在租赁部门，税务部门也可对其偷逃税作出处罚。
