一、由谁来证明存在加班事实
劳动争议中加班费争议，必须要证明存在加班的事实，否则加班费就无从谈起。根据《司法解释三》第九条“劳动者主张加班费的，应当就加班事实的存在承担举证责任。但劳动者有证据证明用人单位掌握加班事实存在的证据，用人单位不提供的，由用人单位承担不利后果”的规定，即存在加班事实的一般举证责任分配规则与特殊举证责任分配规则的结合原则。
一般举证责任分配上，劳动者应承担提供初步证据证明存在加班事实的责任，这里的初步证据可以有考勤表复印件、工资条、多名证人的证言等。如果用人单位提供不了初步证据证明存在加班事实的，以一般“谁主张、谁举证”的规则，劳动者就应该承担举证不能的法律后果。
特殊举证责任分配上即举证责任倒置，如果劳动者有证据证明用人单位掌握加班事实存在的证据，举证责任就倒置到了用人单位。对于是否存在加班的事实就应该由用人单位提供证据证明，劳动者因其提供了证据证明该证据由用人单位掌握，其就免除了加班事实的证明责任。如果用人单位不提供或者不能提供由其掌握的存在加班事实的证据的，该用人单位就要承担相应的不利后果即人民法院会直接认定存在加班的事实。
二、由谁来证明加班时间
劳动者起诉追偿加班费，在存在加班事实的情况下，必然涉及加班时间的确定。如果用人单位与劳动者对加班时间没有争议，自然不存在加班时间的举证责任分配。但因实践中加班时间的复杂性，用人单位与劳动者经常对加班时间存在争议，既然有争议，就必然会存在加班时间的举证责任分配。现在很多用人单位都实行打卡制度，考勤中的打卡时间，仅仅只能初步证明劳动者那段时间一直呆在单位，也就是在单位停留的时间，但这个时间是否全部属于加班时间，还是有部分属于加班时间，有部分属于劳动者在单位私自逗留时间，这就涉及双方的证明责任。
《劳动合同法》第三十一条规定“用人单位应当严格执行劳动定额标准，不得强迫或者变相强迫劳动者加班。用人单位安排加班的，应当按照国家有关规定向劳动者支付加班费”。从该条规定我们可以看出，用人单位安排加班的，应当按照国家有关规定向劳动者支付加班费。也就是说，只有用人单位安排加班的，用人单位才需要支付加班费。因此，对于是否需要加班的，劳动者就应该要对是用人单位安排加班承担举证责任。如果用人单位没有安排加班，劳动者主动要求加班或者自行私自安排加班的，用人单位可以不支付加班费。当劳动者提供了证据证明了单位安排了加班，并有相关考勤记录的，应当认定考勤记录的时间为劳动者的加班时间。如果用人单位否认劳动者考勤记录上的时间只有部分是加班时间的，对于具体加班的时间确定，就应该由用人单位来承担举证责任。
